что такое коронавирусный штамп
Так ли страшны новые штаммы? Ответы на самые важные вопросы о мутациях коронавируса
Появление новых штаммов коронавируса, имеющих необычные свойства, вызывают тревогу людей во всем мире. Руководитель научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов рассказал о том, что сейчас известно о мутациях COVID-19 и нужно ли будет ежегодно от него прививаться, как мы это делаем в случае с гриппом.
— Сколько всего штаммов коронавируса выявлено на сегодняшний день в мире?
— В первую очередь стоит обратиться к определению штамма вируса как некоторого варианта патогена, который обладает уникальными и стабильными фенотипическими характеристиками. При этом стоит отметить, что вирусы, особенно РНК-содержащие, постоянно мутируют, перебирая разные варианты изменений в геноме, и даже внутри одного человека может содержаться множество версий одного вируса, отличающихся отдельными изменениями в геноме, которые далеко не всегда приводят к образованию нового штамма.
Варианты SARS-CoV-2 циркулируют во всем мире, и после появления некоторые варианты довольно быстро исчезают, другие, наоборот, закрепляются в популяции, процесс динамический. Сколько всего штаммов нового коронавируса существует в природе на данный момент, неизвестно, в том числе из-за размытости самого понятия и факта того, что свойства многих геновариантов вируса пока не изучены.
Так, популярный ресурс PANGO lineages выделяет значительное число отдельных линий патогена, и различные организации во всем мире изучают варианты вируса, чтобы понять, являются ли они более контагиозными, изменяющими тяжесть течения заболевания, детектируемыми доступными диагностическими тестами, отвечающими на терапию, изменяющими эффективность вакцин против COVID-19 и т.п. Потому куда чаще термин «штамм» используется для каких-то особо интересных вариантов патогена, как, например, британского или южноафриканского, которые характеризуются ключевыми изменениями в геноме и имеют важные (часто выгодные патогену) свойства. Так, было введено понятие VoC (от англ. Variants of Concern. — Прим. ред.) — «варианты, вызывающие беспокойство», к которым сейчас причисляют несколько штаммов, включая вышеперечисленные.
— Сколько из них есть в России?
— Строгого ответа нет. Какая-то доля всех штаммов коронавируса, которые распространяются на планете, есть уже и в России, какие-то будут завезены в будущем, какие-то появятся у нас в стране независимо. Ученые во многих лабораториях в мире и в нашей стране сейчас проводят активную работу по секвенированию геномов патогена из различных регионов, чтобы как можно быстрее выявлять новые варианты, мониторить скорость их распространения, устанавливать источники заносов из-за рубежа, определять свойства, корректировать тест-системы в случае необходимости. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.
— Какие штаммы коронавируса самые опасные и проникают внутрь всего организма, а какие — наоборот?
— Как уже говорил выше, само определение штамма подразумевает новые стойкие свойства патогена. Чаще всего приходится иметь дело либо с повышенной заразностью вируса (как, например, в случае с британским штаммом, который, по различным оценкам, примерно на 50% более заразен, чем другие, «старые» версии), либо же со снижением эффективности связывания с нейтрализующими антителами, возникшими после вакцинации или перенесенного ранее заболевания (так в случае с южноафриканским вариантом).
При этом сразу хотел бы отметить, что уменьшение эффективности вовсе не означает отсутствие защиты, но она может быть несколько снижена. В любом случае всячески выступаю за вакцинацию, которая если и не защитит на 100% от заболевания, то может кардинально снизить тяжесть его протекания.
— Какие штаммы наиболее всего распространены в Москве, какими больше всего болеют в России?
— За последнее время мы видим несколько сотен завозов британского штамма как по России, так и в Москве, что вполне ожидаемо ввиду его свойств. Появляются и некоторые локальные российские версии вируса, у которых встречаются мутации в геноме, характерные для британского и южноафриканского вариантов, но пока преждевременно говорить о том, что они действительно обладают какими-то особыми для людей свойствами. По этой же причине мы не хотели бы сейчас раздавать новые имена таким вариантам, по крайней мере до накопления достаточного объема данных.
— От всех ли штаммов болезнь длится одинаково или есть разница?
— В какой-то момент появилась информация, что пациенты с британским вариантом инфекции болеют тяжелее, и летальность в таких случаях выше. Это впоследствии было опровергнуто другими исследованиями, и с тех пор я не видел новой информации. Похожая информация появлялась и про калифорнийский вариант.
Нужно отметить, что тяжесть протекания заболевания зависит от множества факторов, и, как известно, многие вообще переносят болезнь бессимптомно, кто-то же крайне тяжело. Такие факторы, как наличие сопутствующих заболеваний, общее состояние организма, возраст, играют существенно большую роль в развитии тяжелой болезни, чем наличие мутаций в геноме патогена, по крайней мере известных на данный момент.
— Может ли бы такое, что к одному штамму коронавируса у человека есть иммунитет, а к другому нет?
— Перенесенная ранее коронавирусная инфекция или вакцинация в норме вызывают иммунный ответ, и в результате в организме появляются нейтрализующие антитела, хотя защита обусловлена не только ими, потому не стоит пугаться, даже если уровень антител невысок или падает. Но да, мы уже знаем, что ряд мутаций в геноме нового коронавируса приводит к изменениям в структуре его белков, придавая патогену новые свойства, иногда удачные для патогена, в том числе с точки зрения снижения связывания нейтрализующими антителами. Потому точно ответить, что к одному штамму у человека есть иммунитет, а к другому нет, нельзя, но эффективность защиты может быть разной, в зависимости от того, с каким новым вариантом вируса вновь встретился пациент.
В связи с этим достаточно вероятна ситуация, что вакцины против нового коронавируса придется периодически обновлять и иммунизироваться ежегодно, как это сейчас происходит с тем же вирусом гриппа. Думаю, к осени мы накопим достаточное количество данных по эффективности существующих вакцин против новых штаммов. Потому еще раз говорю: на данный момент известных причин избегать вакцинации нет, если только нет прямых противопоказаний по состоянию здоровья.
Что такое мю-штамм коронавируса и насколько он опасен
Большинство вирусов со временем меняется, появляются новые варианты (штаммы) с различными мутациями. Какие-то практически не влияют на свойства вируса, но иные могут изменить способ его распространения, усложнить протекание болезни и снизить эффективность вакцин или лекарств. В мае 2021 года ВОЗ внесла вариант коронавируса B.1.621 в список для дальнейшего мониторинга. После дополнительной экспертной оценки в августе штамм перенесли в список вариантов, «представляющих интерес» (Variants of Interest, VOI), дав ему название «мю».
Мю-штамм коронавируса: насколько распространен в мире
Новый штамм обнаружили в Колумбии в январе 2021 года, к сентябрю его фиксируют уже в 46 странах. Согласно статистике, в мире всего 0,1% людей, зараженных коронавирусной инфекцией, вызванной мю-вариантом. Хотя штамм быстро распространился по Южной Америке, количество заболевших именно им в США и Европе не превышает 1%. Большинство случаев зафиксировано в Колумбии — 39%, и Эквадоре — 13%.
В мире пик заболеваемости мю-штаммом коронавируса пришелся на июль 2021 года, после чего количество случаев пошло на спад. В России случаи заражения этим вариантом пока не выявлены.
Мю-штамм коронавируса: почему ученые заинтересовались именно им, а не другими штаммами
На конец сентября 2021 года существует четыре штамма, обозначенные ВОЗ как наиболее проблемные: «альфа», «бета», «гамма» и «дельта». И два — как вызывающие интерес: «лямбда» и «мю». В число последних попадают варианты с определенными характеристиками:
Вариант мю имеет семь генетических изменений, многие из которых также присутствуют и в четырех наиболее распространенных и опасных штаммах. Мутация P681H, которая есть в варианте «альфа», потенциально ответственна за более быструю передачу вируса. Однако данные еще не подтверждены, так как исследование находится в препринте, то есть его результаты еще не были официально рассмотрены другими учеными.
«Мю» также имеет мутации E484K и K417N, которые есть у вариантов «бета» и «гамма». Они связаны со способностью уклоняться от нейтрализующих антител, о чем пишет журнал Lancet. Эта мутация делает вирус более устойчивым к однократной дозе мРНК-вакцин. Возможно, вариант «мю» может вести себя аналогичным образом.
Мю-штамм коронавируса: симптомы заражения
На текущий момент нет информации о том, что вариант «мю» вызывает специфические симптомы. По данным CDC (Федерального агентства министерства здравоохранения США), заболевание будет протекать так же, как и при заражении другими штаммами коронавируса:
Мю-штамм коронавируса: эффективность вакцин
Пока нет достаточных доказательств того, что существующие вакцины будут неэффективны против варианта «мю». Японские ученые предполагают, что этот штамм может обладать более высокой устойчивостью к антителам. Это значит, что он потенциально опаснее других штаммов для тех, кто переболел коронавирусом или сделал прививку. Статья находится на стадии препринта и еще не прошла рецензирование, поэтому данные и выводы еще не окончательные.
В лабораторном исследовании, проведенном в Риме, ученые сравнили титр антител у людей, привитых Pfizer/BioNTech, к варианту «мю» и группе штаммов B1. Ученые пришли к выводу, что несмотря на новые мутации вакцина по-прежнему стимулирует иммунный ответ и выработку антител против вируса.
Исследований, где проверяется эффективность российских вакцин против мю-варианта коронавируса, пока нет, но опрошенные РБК эксперты считают «Спутник V» достаточно эффективным способом защиты от всех штаммов, известных на сегодняшний день. При всем этом ученые не исключают появления «мю» в России.
Мю-штамм коронавируса: что дальше
На данный момент у ученых мало информации о новом штамме. ВОЗ заявляет, что нужны дополнительные исследования: важно изучить, как изменяется эпидемиология мю-штамма в Южной Америке, особенно с одновременным распространением варианта дельта.
Насколько опасны новые штаммы коронавируса?
В новостях пишут, что за рубежом чуть ли не каждый день появляются новые, все более опасные и заразные штаммы коронавируса. Правда ли, что эти штаммы особенно смертоносны и защищает ли от них вакцинация?
Возбудитель коронавирусной болезни SARS-Cov-2 и в самом деле мутирует — изменяется на генетическом уровне. При этом большая часть генетических изменений не делает вирус заразнее, так что эти мутанты просто исчезают. Их вытесняют более успешные варианты SARS-Cov-2 — либо более заразные, либо более ловкие, которые способны успешнее скрываться от иммунной системы, защищающей наши организмы.
Как устроен коронавирус — «Журнал общественного здоровья»
Однако вовсе не обязательно, что уже переболевшие старым вариантом SARS-Cov-2 непременно заразятся новым. И пока нет причин считать, что в ближайшие дни ученым придется спешно обновлять антикоронавирусную вакцину, а уже привитым — прививаться заново. Риск, что коронавирус научится ускользать от иммунитета уже переболевших и привитых людей, действительно существует. Но судя по имеющимся данным, это ему пока не удалось.
Будьте внимательны к источникам информации о здоровье — и сходите к врачу
Наши статьи написаны с любовью к доказательной медицине. Мы ссылаемся на авторитетные источники и ходим за комментариями к докторам с хорошей репутацией. Но помните: ответственность за ваше здоровье лежит на вас и на лечащем враче. Мы не выписываем рецептов, мы даем рекомендации. Полагаться на нашу точку зрения или нет — решать вам.
Откуда взялись новые штаммы коронавируса и чем они опасны
С тех пор коронавирус с мутацией D614G успел видоизмениться еще несколько раз. Сегодня внимание ученых и врачей приковано к трем наиболее успешным его потомкам.
Новые варианты SARS-CoV-2 — бюллетень американского Центра по контролю и предотвращению инфекционных заболеваний, CDC
Британский вариант коронавируса. Он именуется B.1.1.7. Где именно он возник, до сих пор непонятно, однако впервые вирус обнаружили на юго-востоке Великобритании в сентябре 2020 года. Скорее всего, коронавирус мутировал в организме пациентов с ослабленным иммунитетом, которые болели дольше молодых и в остальном здоровых людей.
Британский коронавирус оказался на 50—70% заразнее предыдущего, то есть он легче передается от человека к человеку. Кроме того, согласно докладу британской комиссии вирусологов NERVTAG мутантный вирус может быть на 30% смертоноснее предыдущего. Но даже если ученые преувеличивают угрозу, ситуация все равно серьезная, ведь чем больше людей заражается, тем больше смертельных случаев.
Отчет британского минздрава о новом штаммеPDF, 474 КБ
Доклад комиссии NERVTAGPDF, 141 КБ
Южноафриканский вариант коронавируса — B.1.351 — был обнаружен исследователями из ЮАР в октябре 2020 года. Хотя возникнуть он мог и в другом месте. При каких обстоятельствах произошла мутация, пока непонятно.
Новый южноафриканский вариант коронавируса — не прошедшая рецензирование статья ученых из ЮАР
Предварительные данные о южноафриканском варианте коронавируса — компания ModernaPDF, 678 КБ
Бразильско-японский вариант коронавируса — B.1.1.28, или P.1. В январе 2021 года Национальный институт инфекционных заболеваний — NIID — в Японии обнаружил его у четырех туристов, которые вернулись из Бразилии. Как произошла мутация, пока непонятно. Японские исследователи, которые расшифровали геном бразильско-японского варианта коронавируса, выяснили, что он похож и на британский, и на южноафриканский. Теперь они опасаются, что новый SARS-CoV-2 сочетает в себе худшие черты обоих вариантов, то есть он и более заразен, и потребует больше антител для нейтрализации.
Как победить выгорание
Как понять, каким вариантом коронавируса вы заразились
Разобраться могут только ученые, у которых есть оборудование для геномного секвенирования — расшифровки вирусного генома. В нашей стране есть научно-исследовательские центры, в которых делают секвенирование коронавирусных геномов, но направляют туда далеко не всех пациентов.
В первую очередь под подозрение попадают пациенты с симптомами простуды, которые недавно вернулись из страны, где появился новый вариант болезни: из Великобритании, Бразилии или ЮАР. Касается это в первую очередь дипломатов, потому что авиасообщение с этими странами временно закрыто. Людей с симптомами простуды, которые прибыли оттуда, могут направить на обследование прямо из аэропорта. У них возьмут мазок и расшифруют коронавирусный геном.
Могут ли уже переболевшие заразиться новыми вариантами вируса
Это возможно, но маловероятно. Ведущие исследователи со всего мира предполагают, что от повторного заражения новым штаммом переболевших защитит адаптивный иммунитет. Так называется компонент иммунной системы, который активируется под воздействием вирусов и использует иммунологическую память, чтобы узнавать новые варианты коронавируса и усиливать иммунную защиту.
В-клетки делятся на два отряда. Одни бойцы — их называют плазматическими В-клетками — создают антитела, атакующие вирусы. Вторые — их называют В-клетками памяти — запоминают, какие именно антитела нужно создавать, и обучают бойцов из первого отряда.
Т-лимфоциты тоже делятся на два отряда. Если немного упростить, то один из них — Т-хелперы — активирует В-клетки и побуждает их к делению. Представители второго отряда Т-клеток — их называют цитотоксическими Т-клетками — атакуют клетки, зараженные вирусами.
Дело в том, что В-клетки памяти не просто печатают антитела по раз и навсегда определенному шаблону. Они постоянно экспериментируют, создавая немного видоизмененные защитные белки. Это позволяет организму действовать на опережение, придумывая обновленные антитела, которые подходят не только к старым, но и к мутировавшим версиям коронавируса.
Тем не менее даже переболевшим людям рекомендуется привиться. Это увеличивает надежность защиты, причем и от старой, и от обновленных версий коронавируса.
Действуют ли вакцины на новые штаммы коронавирусов
Что делать? Читатели спрашивают — эксперты Т—Ж отвечают
Коварный и опасный: как распознать и лечить индийский штамм COVID-19, который уже в России и на подходе к Украине
Что это за «Дельта» такая?
Повышенное внимание сейчас приковано к последнему из-за стремительного распространения — его выявили в 92 странах, то есть им охвачено полмира, он вытесняет другие штаммы (на «Дельту» приходится 99% новых случаев в Великобритании, 90% — в Москве, 56% — в Астане; 23 июня объявлено о выявлении этого штамма в Минске; на Украине, по оценке Национальной академии наук, он появится осенью).
Госпитализаций при «индийском» штамме вдвое выше, чем при «британском»; он заразнее остальных штаммов на 60% (1 заболевший может заразить 5-6 человек, а не 3-4, как раньше); инкубационный период сократился до 7 дней.
По словам врача-инфекциониста Светланы Малиновской, схему лечения приходится постоянно менять, потому что прежние уже не работают на пациентах с «Дельтой».
«Люди поступают, мы отслеживаем их показатели и видим, с какой невероятной скоростью происходит изменение крови буквально за часы. Количество тромбоцитов увеличивается в геометрической прогрессии, у человека моментально возникает тромбоз сосудов. И сразу происходит инфаркт», — рассказала она.
Чем обусловлено такое коварство этого штамма коронавируса, объяснил директор НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи Александр Гинцбург: он не разрушает клетки, а распространяется, переходя из одной клетки в другую, образуя многоядерные клетки. Тем самым, когда он уже проник внутрь, он становится очень устойчив к антителам, которые циркулируют в крови.
Малиновская образно описала «Дельта»-штамм как преступника, который поменял внешность с помощью пластической операции, но отпечатки пальцев у него остались теми же. Необратимо? Потерю обоняния и памяти при COVID-19 объяснили разрушением мозга
Однако это ещё не всё — вирусологи обнаружили новые разновидности этого штамма (B.1.617.2.1 «дельта плюс») в индийских городах Нави-Мумбаи, Ратнагири и Палгаре, власти пытаются сдержать его распространение, изолируя районы, где есть заболевшие.
По итогам исследования этой мутации вируса Индийский консорциум по геномике SARS-CoV-2 отнёс его к числу «вызывающих беспокойство», а Министерство здравоохранения Индии назвало его характеристики: повышенная проницаемость, более сильное связывание с рецепторами клеток лёгких, возможное снижение ответа на моноклональные антитела.
Из-за того, что этот штамм вызывает резкое повышение количества тромбоцитов в крови, возникает риск инфаркта, а также микротромбозов, которые впоследствии провоцируют гангрену и грозят ампутацией конечностей.
Как выявить индийский штамм?
Однако есть и нехарактерные для предыдущих штаммов коронавируса симптомы: боли в животе, диарея, тошнота, рвота, насморк, обильные выделения из носа (как при риновирусе), боли в мышцах, быстрая утомляемость, чувство подавленности и уныния. Кроме того, пациенты жалуются на нарушения слуха.
Кроме того, отметила заместитель директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Наталья Пшеничная, в некоторых случаях изменение основных симптомов может быть связано с одновременным заражением человека двумя вирусами.
«Это может быть и микст-инфекция, например, сочетание риновирусной инфекции, сопровождающейся обильными выделениями из носа, и COVID-19», — уточнила она.
При появлении симптомов респираторной инфекции, расстройстве желудочно-кишечного тракта и повышении температуры Пшеничная посоветовала оставаться дома и сдать тест на коронавирус. Комаровский объяснил, как победить цитокиновый шторм при коронавирусе
Как защититься от индийского штамма?
«Что касается эффективности вакцин, мы знаем, что в отношении всех вариантов, вызывающих беспокойство, включая вариант «Дельта», вакцины остаются эффективными против тяжёлых форм заболевания и смертности», — заявила руководитель технической группы подразделения чрезвычайных заболеваний ВОЗ Мария Ван Керкхове.
Однако необходимо получить обе дозы препарата.
По предварительной оценке британских учёных, западные вакцины защищают от индийского штамма на 33% после первой дозы и на 81% — после второй. Исследование НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи показало, что «Спутник V» более эффективен против «дельта»-коронавируса, чем другие препараты, изученные для борьбы с этим штаммом.
Тем не менее, просто переболеть или сделать прививки в случае с индийским штаммом уже недостаточно — иммунитет для противостояния ему должен быть вдвое сильнее, чем в случае с уханьским, поэтому важно следить за уровнем антител в организме. Получить необходимые показатели, в том числе переболевшим и вакцинировавшимся ранее, поможет ревакцинация «Спутником Лайт» (по сути это 1-й компонент «Спутника V»). Врачи рассказали, когда нужно прививаться переболевшим коронавирусом
Разработчики «Спутника V» в ближайшей перспективе обещали представить дополнительную инъекцию, разработанную специально против индийского штамма и близких ему вариаций коронавируса.
Если предотвратить заболевание всё-таки не удалось, прежде всего следует самоизолироваться, вызвать врача на дом, а не ходить в поликлинику и аптеку (можно воспользоваться доставкой лекарств на дом или попросить близких оставить пакет около двери). Схема лечения хорошо известная: промывание носа морской водой, обильное тёплое питьё, при наличии температуры парацетамол или ибупрофен, больше отдыха.
«Иммуномодулирующие препараты неэффективны, а также, возможно, небезопасны. Антибактериальная терапия должна назначаться строго при подтверждении бактериальных осложнений, а не в первые дни болезни «на всякий случай», — предупреждает иммунолог Мария Польнер.
Кроме того, ни в коем случае нельзя самостоятельно назначать себе препараты против образования тромбов (антикоагулянты), поскольку они повышают риск кровотечений.
Если после улучшения состояния вновь поднялась температура или на протяжении нескольких дней сохраняются одышка, боли за грудиной, лихорадка, нужно вызвать скорую помощь и решить вопрос о проведении КТ и госпитализации.
У переболевших коронавирусом в 85% возникают те или иные осложнения, поэтому всем перенесшим это заболевание через 2 месяца обязательно рекомендуется сдать коагулограмму, чтобы проверить, не повлиял ли COVID-19 на свёртываемость крови.
Пять новых штаммов коронавируса: чем опасны и чего от них ждать?
Гид по новым вариантам (штаммам) вируса, вызывающего COVID-19 и генетическим изменениям, которые могут сделать его более контагиозным и неуловимым для иммунной системы.
Когда прошлой зимой коронавирус SARS-CoV-2 ворвался в мир, ученым стало ясно, что дело плохо, но они посчитали, что вирус, по крайней мере, стабилен. Коронавирусы не мутируют так быстро, как, например, вирусы гриппа, гепатита или ВИЧ, — отчасти благодаря системе молекулярного редактирования, которую SARS-CoV-2 и родственные ему вирусы используют для предотвращения злокачественных генетических ошибок при репликации.
Но ученые были правы лишь наполовину. Вирус и правда не принес ничего хорошего — но оказалось, что и стабильностью он не отличается. С тех пор, как SARS-CoV-2 «перепрыгнул» с животных на людей, он накапливал незначительные случайные мутации: как однобуквенные «опечатки» в генетической последовательности вируса, так и вставки или выпадение более длинных фрагментов вирусной РНК. Большинство мутаций либо убивают вирус, либо никак не меняют его строение и поведение.
Но недавно было обнаружено несколько новых штаммов оригинального вируса (его также называют «вирусом дикого типа»), мутации которых, похоже, сильно влияют на его свойства, в том числе на контагиозность. Эти штаммы были обнаружены один за другим в разных географических регионах (Великобритания, ЮАР, Бразилия) и в некоторых случаях стали доминировать над штаммами, распространенными в этих регионах ранее. Одновременное появление сразу нескольких штаммов в поле зрения ученых частично объясняется улучшением технологий мониторинга случаев заражения и увеличением объемов секвенирования вирусов. Однако схожесть паттернов мутаций в новых штаммах может указывать на то, что эти изменения не случайны.
«Мы видим, как похожие мутации появляются в разных местах, — говорит Адам Лоринг, вирусолог из Мичиганского университета. — Это наводит на размышления о том, что они для чего-то нужны».
Пока что известно, что эти мутации помогают вирусу легче передаваться от человека к человеку и оставаться незамеченным иммунной системой. В январе ученые впервые сообщили, что антитела людей, переболевших COVID-19, не полностью нейтрализуют штамм вируса, обнаруженный в ЮАР. Кроме того, похоже, несколько человек, перенесших COVID-19, повторно заразились мутантным штаммом.
По последним данным, вакцины, производимые компаниями Moderna и Pfizer, скорее всего, защищают и от новых штаммов коронавируса. Разработчики «Спутника V» также заявили о его эффективности против мутировавшего вируса. Эффективность вакцин этих производителей превышает 90 %, поэтому, по мнению экспертов, даже при небольшом снижении этой цифры их все равно стоит использовать.
«Я рад, что это не лишает смысла [использование вакцин от COVID-19], но, очевидно, требует пристального внимания», — говорит Лоринг. Он добавляет, что на протяжении следующих лет компаниям, возможно, придется изменить эти вакцины и начать вводить пациентам новые их версии — подобно тому, как каждый год меняют вакцины от гриппа. Большинство вакцин вызывают намного более сильный иммунный ответ, чем естественное заражение вирусом. Во время клинических испытаний своей вакцины компания Moderna показала, что антитела, вырабатываемые после вакцинации, остаются в организме дольше, чем антитела, вырабатываемые при естественном заражении SARS-CoV-2.
по теме
Эпидемия
Вакцины, антитела, антигены. Гид по иммунологии для чайников
Ниже перечислены пять наиболее значимых штаммов коронавируса в порядке обнаружения учеными. В списке указано место первого выявления каждого из них и официальные названия штаммов или обозначения, используемые исследователями. (Разные группы исследователей используют разные способы обозначения штаммов, что вызвало путаницу. В этом списке использованы наименования, основанные на филогенетическом происхождении штаммов, но некоторые варианты вируса все равно имеют больше одного названия). Также здесь приведены важные мутации каждого штамма (названия мутаций состоят из букв и цифр, обозначающих позицию мутации в геноме вируса) и известная информация о том, что эти мутации делают.
Испания
Штамм 20A.EU1, впервые выделенный в Испании, содержит мутацию A222V в последовательности белка шипа. Шип — структура вируса SARS-CoV-2, которая связывается с рецепторами клеток ACE2 человека, помогая вирусу проникать внутрь этих клеток при заражении. Кроме того, именно с шипами связываются антитела человека, вырабатываемые для иммунного ответа на инфекцию. Лабораторные исследования показали, что человеческие антитела немного менее эффективно нейтрализуют вирусы с мутацией A222V. За несколько месяцев штамм 20A.EU1 стал доминирующим в Европе. Тем не менее эпидемиологи не наблюдали доказательств того, что этот штамм быстрее передается от человека к человеку, чем оригинальный вирус. Исследователи считают, что штамм, который на тот момент доминировал в Испании, распространился по всему континенту, когда в Европе начали ослаблять ограничения на перемещение.
Великобритания
Британские ученые наблюдали за штаммом B.1.1.7 некоторое время, прежде чем объявили в декабре, что он может передаваться как минимум на 50 % активнее, чем вирус дикого типа. Это заявление было основано на эпидемиологических данных, указывающих, что вирус нового штамма быстро распространяется среди населения, и привело к запретам на пересечение границ и усилению карантинных мер в Великобритании.
Штамм B.1.1.7 содержит 17 мутаций, некоторые из них затрагивают белок шипа. Было обнаружено, что одна из этих мутаций, N501Y, помогает вирусу прочнее связываться с рецепторами клеток ACE2. Однако пока неясно, обусловлена ли повышенная контагиозность данного штамма только этой мутацией или еще какими-либо изменениями структуры шипа.
Несмотря на первоначальное беспокойство, не было найдено подтверждений тому, что этот штамм более заразен для детей в сравнении с оригинальным, говорит Шерон Пикок, исполнительный директор Консорциума Великобритании по геномике COVID-19 (COG-UK), группы, анализирующей генетические изменения вируса. И Pfizer, и Moderna считают, что их вакцины от COVID-19 будут работать и против штамма B.1.1.7. Недавние данные из Великобритании указывают на то, что новый штамм может быть более летален по сравнению с диким типом, но это пока только предварительные результаты.
Штамм B.1.1.7 выделяется на фоне других, потому что он накопил так много мутаций. Лоринг и другие исследователи полагают, что эти мутации могли возникнуть при длительном заражении одного пациента с ослабленным иммунитетом, из-за чего организм пациента не мог побороть вирус. По словам Скотта Вивера, микробиолога из медицинского подразделения Техасского университета в Галвестоне, возможно, только некоторые из этих генетических изменений дали штамму эволюционное преимущество и позволили ему быстро распространиться по Великобритании. Остальные мутации просто остались в геноме за компанию.
Штамм B.1.351 появился в поле зрения ученых примерно в то же время, что и британский B.1.1.7. B.1.351 быстро распространился и стал доминантным вариантом вируса в ЮАР. Как и европейский штамм, B.1.351 содержит мутацию N501Y, хотя данные указывают, что два этих штамма возникли независимо друг от друга. Но ученых больше беспокоит другая мутация в африканском штамме, обозначаемая E484K. Это изменение в геноме, возможно, помогает вирусу избегать иммунного ответа и действия вакцин.
Эволюционный биолог и биоинформатик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле Джесс Блум с командой с помощью клеток дрожжей создали серию вирусных белков-шипов, содержащих практически все из более 3800 возможных изменений в структуре, которые могут быть вызваны генетическими мутациями. Затем исследователи протестировали, насколько хорошо антитела связывались с каждым из этих видоизмененных шипов. Они обнаружили, что в результате мутации E484K и других похожих мутаций в этом конкретном участке белка антитела некоторых людей в 10 раз хуже связывались с шипами коронавируса. Команда Блума также показала, что некоторые коктейли из антител (подобные коктейли в настоящий момент тестируют фармацевтические и биотехнологические компании Regeneron и Eli Lilly) могут быть менее эффективными при наличии мутаций, которые имеются в штамме B.1.351.
В конце января ученые из ЮАР опубликовали препринт (научная статья, которая еще не прошла независимую рецензию), в котором показали, что сыворотка крови пациентов с COVID-19, содержащая антитела, значительно менее эффективно могла нейтрализовать новый штамм. В другом препринте, опубликованном 26 января, ученые сообщают, что они добавили вирус B.1.351 в сыворотку крови, взятую у людей, которым ранее ввели вакцину производства Pfizer или Moderna. В результате антитела в такой сыворотке проявляли сниженную нейтрализующую активность по отношению к мутантному вирусу в сравнении с вирусом дикого типа.
Однако антитела в пробирке — не то же самое, что вакцина в организме живого человека. В результате применения любой из упомянутых вакцин организм производит столько антител, что даже при сниженной активности их может быть достаточно для нейтрализации вируса. Вакцины также запускают работу других защитных механизмов иммунной системы. Тем не менее Moderna начала разработку бустерной вакцины, специфичной по отношению к новым штаммам.
Бразилия
В январе ученые сообщили об обнаружении двух новых вариантов коронавируса в Бразилии, происходящих от общего предка. Но хотя у этих двух штаммов есть общие мутации с вариантами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо.
Из этих двух штаммов ученых больше беспокоит P.1. Он содержит больше мутаций, чем Р.2 (хотя оба штамма имеют мутацию E484K), и уже был обнаружен в Японии и других странах. Возможно, Р.1 накопил свои мутации в организме пациента с ослабленным иммунитетом. Но генетик Эмма Ходкрофт из Бернского университета в Швейцарии говорит, что в этом случае может быть сложнее определить точное время и место возникновения штамма, поскольку в Бразилии секвенируют гораздо меньше образцов вируса, чем в Великобритании.
Ходкрофт отмечает, что в 2020 году и в Бразилии, и в ЮАР были крупные вспышки COVID-19. При таком большом количестве зараженных людей, вырабатывающих антитела к вирусу, штамм, способный избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, мог иметь значительное преимущество и широко распространиться в популяции.
Распространение и изменение вирусов
Хотя кажущееся внезапным появление нескольких вариантов белка шипа является причиной для беспокойства, по словам исследователей, пока нет доказательств, что коронавирус претерпел какие-либо принципиальные изменения, позволяющие ему мутировать быстрее. По мнению Лоринга, более вероятно, что большое число заражений COVID-19 по всему миру предоставляет вирусу множество возможностей для постепенных небольших изменений. Каждый зараженный человек — это, по сути, дополнительный шанс для возникновения нового штамма SARS-CoV-2. «Это имеет отношение к эволюции, но в первую очередь — это вопрос эпидемиологии», — говорит Лоринг. В целом «вирус совершенствуется в своей роли».