что такое мазок методом пцр

ПЦР-тестирование: как работает метод ПЦР в диагностике

ПЦР – высокоточный метод диагностики и одно из самых главных открытий в области биологии за последние десятилетия. ПЦР-анализ применяется уже почти 40 лет и считается наиболее точным и чувствительным способом диагностики инфекционных заболеваний.

ПЦР – уникальный и универсальный метод, тест используется не только в клинической лабораторной диагностике, но также в биологии, криминалистике, археологии и многих других научных областях. Все, что нужно для проведения анализа – небольшое количество любого биоматериала пациента.

Суть метода ПЦР

ПЦР – полимеразная цепная реакция. Метод основан на обнаружении даже небольших концентраций искомого элемента диагностики. Для определения изначально крайне малых концентраций РНК или ДНК, которые необходимо определить в процессе проведения основного этапа исследования, используется метод искусственного увеличения количества РНК или ДНК. А поскольку они специфичны и строго индивидуальны для каждого микроорганизма или живого существа за счет уникальности последовательности нуклеотидов во фрагментах, ошибка в определении целевого ДНК или РНК исключена.

Генетическая информация любого живого организма записывается в ДНК. Эта молекула состоит из двух цепочек, сплетающихся в единую спираль. Некоторые вирусы (например, COVID-19) хранят свой код в РНК – одной нити нуклеотидов.

Для каждого организма, включая вирусы, бактерии и грибки, последовательность нуклеотидов уникальна. Ее можно сравнить с отпечатком пальца или сканом сетчатки глаза человека. Укороченные последовательности нуклеотидов, характерные для каждого вида патогена (возбудителя опасных заболеваний), хранятся в базах научных лабораторий в виде праймеров – отдельных участков ДНК, типичных для только конкретного возбудителя. Эти участки значительно короче любой молекулы ДНК. Такие праймеры присоединяются к ДНК возбудителя в пробе и под действием катализаторов многократно воспроизводят свои дубли. Этот процесс называются «репликация» – многократное увеличение, дублирование искомого участка до тех пор, пока он не станет доступен для определения. Процесс репликации возможен только при наличии в пробе ДНК возбудителя.

Преимущества метода ПЦР

Какие есть недостатки

Показания к проведению ПЦР-анализа

Подготовка к проведению ПЦР-теста

Как проводится ПЦР-анализ

Результаты ПЦР-теста

Результаты анализов, проведенных методом ПЦР, известны уже через один день. Иногда возможно проведение экстренного теста – его часто используют при оказании срочной медицинской помощи при госпитализации. Тогда срок готовности результата сокращается до считанных часов.

Результаты ПЦР-теста дадут точную информацию о том, какая инфекция была обнаружена. При количественном тестировании анализ определит также вирусную или бактериальную нагрузку на организм. В этом случае в результатах будет значиться титр обнаруженного патогена (его количество в одном миллилитре пробы). Количественный анализ особенно важен при диагностике заболеваний, спровоцированных условно-патогенными микроорганизмами, которые присутствуют в норме практически у каждого человека. Такие микроорганизмы представляют угрозу только при большой численности, а в остальных случаях мирно сосуществуют с носителем.

Источник

Принцип ПЦР исследования

Что такое полимеразная цепная реакция (ПЦР)? Практически каждый человек в жизни сталкивается с этим методом, даже если не знает об этом. ПЦР исследует генетический материал – ДНК или РНК. Благодаря открытию ПЦР медицина и наука вышли на новый уровень и стала возможной точная диагностика различных инфекций, наследственных и онкологических заболеваний, установление отцовства и даже клонирование генов. ПЦР широко используется в криминалистике, раскопках и других областях, поскольку источником ДНК может быть капля крови, оставленная на месте преступления или человеческий волос, и даже останки мумии или мамонта, пролежавших тысячи, миллионы лет…

Но сегодня нас будет волновать ПЦР как точный метод диагностики инфекционных заболеваний, где он заслуженно удостоен звания «золотой стандарт». В основе метода – поиск ДНК микроорганизмов, то есть точное установление «личности» микроба, ставшего причиной заболевания.

Как работает ПЦР?

Всем известно из курса биологии, что генетический материал всего живого на Земле представлен двухцепочечной молекулой ДНК (кроме некоторых вирусов, содержащих РНК). Каждая цепочка ДНК состоит из комбинации четырех нуклеотидов. Да-да, нуклеотидов всего 4, но из них составлен генетический материал всех живых существ. Разница лишь в определенной последовательности нуклеотидов в цепочках ДНК. Зная уникальный порядок нуклеотидов в участке ДНК искомого микроорганизма, возможно его выявить в любом биологическом материале.

Принцип ПЦР заключается в многократном удвоении (амплификации) участка ДНК при помощи специальных ферментов.

Почему реакция называется полимеразная цепная?

В чём преимущества ПЦР?

Для грамотного применения метода следут запомнить следующие моменты:

ПЦР выявляет ДНК возбудителя независимо от того, живой он или мёртвый, поэтому:

Для выявления ДНК внутриклеточных инфекционных агентов ( например, вирусов) нужны клетки, поэтому:

Слизь, кровь и гной могут заблоктровать реакцию ПЦР, поэтому:

Проведение ПЦР требует строго соблюдения условий технологии, поэтому в лаборатории KDL:

Будьте здоровы и обследуйтесь в лаборатории, которой доверяете!

Источник

ПЦР-диагностика

Полимеразно-цепная реакция (ПЦР) – это одно из самых ярких достижений в сфере молекулярной биологии. Метод получил широчайшее распространение в разных областях науки. Благодаря очень высокой специфичности и чувствительности, метод ПЦР применяется в медицине, биологии, ветеринарии, криминалистике, санитарной службе и других отраслях деятельности человека.
Для анализа методом ПЦР можно использовать любые биологические материалы, которые содержат нуклеиновые кислоты (молекулу ДНК или РНК).

Принцип ПЦР- исследования

Кому мы обязаны появлением метода ПЦР?

Со слов американского биохимика Керри Мюллиса (Kary Mullis), идея идентифицировать живые организмы по короткому участку их генетического кода (ДНК) пришла ему в голову в 1983 году, по пути с работы домой. А в основе этой идеи, лежала работа другого американского биохимика, Артура Корнберга (Arthur Kornberg), которая в свое время не нашла отклика у научного сообщества.

Керри допустил возможность того, чтобы взять молекулу ДНК какого-либо организма, с помощью высокой температуры «распустить» ее спираль на две нити, специфическими маркерами-праймеры пометить уникальные для этого микроорганизма участки ДНК и затем, применив фермент ДНК-полимеразу, создать из двух нитей две новые молекулы ДНК. Но уже содержащие в себе меченные праймеры. И потом останется просто искать эти участки в диагностическом материале.

В итоге, корпорация CETUS, в которой работал Мюлис, выделила ему команду ученых. И в 1985 году, в издании Американского общества генетики человека, появилась публикация с теоретическим обоснованием ПЦР, как метода идентификации генетического материала живых организмов.

Как это все происходит в лаборатории

Выделение ДНК

Элонгация

Или синтез. После завершения процесса отжига, в реакционной смеси создают условия для активности полимеразы. Фермент, ориентируясь на молекулы праймеров (а не исходных нуклеиновых кислот), начинает синтез новых ниток ДНК/РНК. Которые становятся копиями исходных, искомых молекул нуклеиновых кислот.
Такой температурный цикл проводится 30 и более раз. В результате, даже при изначально небольшом количестве искомого генетического материала, в реакционной смеси накапливается значительное число «помеченных» праймерами нуклеиновых кислот (растет экспоненциально, с удвоением при каждом цикле).Обнаружить большие количества ДНК/РНК намного проще, за счет чего реализуется еще одно преимущество ПЦР – высочайшая чувствительность.

Детекция

Оценка результатов ПЦР проводится несколькими путями:

Преимущества методики ПЦР

Всего разработано более 10 разных методик амплификации, применяемых лабораториями в зависимости от исходных условий и поставленных целей.
Общим для них есть высокая чувствительность (для положительного результата достаточно 40 (!) или менее искомых копий ДНК в 1 мл образца, то есть вероятность ложноотрицательного ответа ничтожно мала. И очень высокая специфичность: вероятность ложноположительного ответа составляет менее 1%.
Но точность результатов сильно зависит от качества сбора диагностического материала, тщательного соблюдения всех технических требований к каждому этапу и качеству оборудования, расходных материалов (буфера, праймеров, раствора для отмывки и т.д.).

Области применения в медицине

В дерматовенерологии ПЦР используют для выявления венерических заболеваний: микоплазменной, хламидийной инфекций, сифилиса, генитального герпеса и др.
Инфекционисты активно используют ПЦР для диагностики туберкулеза, ВИЧ, вирусных гепатитов, герпеса, мононуклеоза, вируса Эпштейн-Барр и др.). А с помощью ПЦР в реальном времени, оценивая вирусную нагрузку, врачи могут составить мнение о динамике заболевания, отклике на лечение, что особенно актуально для пациентов с ВИЧ, принимающих терапию.
Также благодаря ПЦР врачи могут в течение нескольких дней с уверенностью идентифицировать коклюш и паракоклюш, выявить возбудителей эпидемии ОРВИ. Уточняются типы вируса гриппа, циркулирующие на определенной территории, на основании чего появляется возможность разработать эффективную вакцину для каждого сезона гриппа.
В течение суток или быстрее можно установить вид возбудителя кишечной инфекции, а значит – назначить адекватное лечение и обнаружить вероятный источник заражения.
Летом, ПЦР актуальна для диагностики заболеваний, передаваемых иксодовыми клещами: боррелиоза (болезни Лайма), клещевых энцефалитов.
Метод позволяет работать с любым биологическим материалом. Гемотрансмиссивные инфекции (сифилис, ВИЧ, гепатиты, боррелиоз) исследуются по пробе венозной крови или спинномозговой жидкости. Кожные болезни (герпес, грибки) – по соскобу с пораженного участка. Венерические и урологические – по образцу мочи, спермы, влагалищного отделяемого.
Так что в медицине, ПЦР применяется везде, где нужна высокая точность и быстрота получения результатов.

Лабораторные исследования, выполняющиеся методом ПЦР:

Источник

ПЦР у женщин

В этой статье Вы узнаете, как берут ПЦР у женщин, как проводится подготовка к ПЦР женщине, и что такое ПЦР тестирование у женщин.

Вы узнаете, как берут кровь на ПЦР у женщин, и, на какие инфекции проверяют мазок.

ПЦР (полимеразная цепная реакция) у женщин позволяет выявить заболевания, передаваемые половым путем.

С целью обследования методом ПЦР берется мазок из влагалища, шейки матки и цервикального канала у женщин.

Также при необходимости исследуют мазок со слизистой ротовой полости, анального отверстия, мочу, кровь.

На какие инфекции смотрят кровь ПЦР у женщин

В специальный аппарат помещают биоматериал, а именно мазки со слизистых оболочек.

Добавляется фермент, который помогает синтезировать копию генетического материала микроорганизма (ДНК или РНК) в несколько этапов.

Как берут мазки для ПЦР у женщин?

Мазок берет венеролог или врач-гинеколог, с помощью специального деревянного шпателя, из наружного отверстия уретры, шейки матки и влагалища.

О том как проходит ПЦР
у женщин рассказывает
врач гинеколог
Гаряева Ирина Владимировна

Содержание данной статьи проверено и подтверждено на соответствие медицинским
стандартам врачем дерматовенерологом, урологом, к.м.н.

Ленкиным Сергеем Геннадьевичем

Подготовка к сдаче анализа на ПЦР женщине заключается

Подготовка к сдаче анализа на ПЦР женщине заключается в следующем:

Метод ПЦР позволяет выявить следующие заболевания:

Но это далеко не полный перечень инфекций.

Врач венеролог назначает анализ крови на ПЦР женщине при подозрении на наличие таких заболеваний как:

Когда после заражения сдают анализ мазка и крови на ПЦР у женщин?

Если Вам нужен контроль после антибиотиков, обычный ПЦР у женщин не покажет точные результаты.

Контрольный после лечения анализ назначается в виде бактериологического исследования, ПЦР у женщин малоинформативен.

Это связано с тем, что ПЦР у женщин получается ложноположительный.

Маленькие частички убитого инфекционного агента дают такую положительную реакцию.

Количественный результат ПЦР у женщин: что это

Когда нужно выполнять ПЦР тестирование количественным методом?

Именно для контроля после курса антибиотикотерапии можно использовать количественную методику ПЦР.

В отличие от обычного ПЦР, это метод даст представление о количестве возбудителя.

Результаты обследования обычно готовы через 1-2 дня.

Срок подготовки результатов зависит от клиники, удаленности лаборатории и других факторов.

Мазок изо рта: на какие ЗППП выполняется ПЦР у женщин

Некоторые половые инфекции, могут передаваться во время орального полового акта.

Кроме того, существует ряд иных заболеваний, при которых может потребоваться мазок на ПЦР из зева.

В ротовой полости женщины могут быть обнаружены такие инфекции как:

Мазок из ануса: на какие инфекции выполняется ПЦР у женщин

Некоторые инфекции передающиеся половым путем способны развиваться и после анального секса в микрофлоре прямой кишки.

При этом у женщины возникает воспаление прямой кишки – проктит.

Не редкостью является и активизация неспецифической микрофлоры прямой кишки.

Возможно развитие кандидоза.

В случае попадания папилломавируса человека, на стенках прямой кишки могут появиться папилломы или бородавки.

Наиболее распространёнными инфекциями, которые обнаруживаются при заборе материала из прямой кишки, являются:

Где сдать анализы ПЦР у женщин?

Женщина может сдать анализ на ПЦР в частном или государственном кожно-венерологическом диспансере.

В частном КВД, вы можете сдать анализ анонимно и гораздо быстрее, по сравнению с государственным.

Сколько по времени делают анализы мазков и крови на ПЦР у женщин?

После сдачи материала, Вы получите расшифровку анализа на ПЦР через 1-2 суток, но в некоторых ситуациях, возможно получить результаты и в первый день.

Ложноотрицательный и ложноположительный ПЦР у женщин

Существует небольшая вероятность того, что результат анализа ПЦР будет ложным.

На результат могут и внешние факторы, связанные с технической оснащенностью лаборатории.

Поэтому наша клиника оснащена наиболее современным оборудованием.

Это позволяет минимизировать появление ложноположительного или ложноотрицательного результата.

ПЦР у женщин: цена

В зависимости от выбранной Вами клиники, цена может отличаться.

Цена зависит и от выбранной диагностируемой инфекции.

В нашей клинике цена анализа ПЦР на ИППП составляет 300 рублей.

Какой врач назначает анализ ПЦР у женщин

Врач, какой специальности может назначить анализ ПЦР у женщин?

Чаще всего анализы на инфекции назначает гинеколог или уролог.

Анализ крови на ВИЧ, методом ПЦР у женщин назначает врач инфекционист или венеролог.

Метод полимеразной цепной реакции отличается

Метод полимеразной цепной реакции отличается высокой чувствительностью и специфичностью.

Достаточно совсем немного исследуемого материала и, соответственно, ДНК или РНК бактерий и вирусов, чтобы выявить наличие или отсутствие тех или иных возбудителей.

Более того, с помощью метода ПЦР можно определить тип конкретного возбудителя.

Как подготовиться к мазку ПЦР у женщин

Давайте разберем, как подготовиться к мазку ПЦР у женщин.

Существует перечень правил, которые следует соблюдать перед анализом ПЦР.

Интерпретация результатов ПЦР у женщин

Интерпретация результатов ПЦР у женщин проводится врачом специалистом.

Результат может быть:

Результаты анализов непременно должен оценить наблюдающий врач, и при необходимости назначить лечение.

При необходимости сдать ПЦР анализы обращайтесь к автору этой статьи – венерологу, урологу в Москве с 15 летним опытом работы.

Источник

Роспотребнадзор (стенд)

Роспотребнадзор (стенд)

ПЦР – диагностика. Просто о сложном

ПЦР – диагностика. Просто о сложном

С чего она начиналась. Конечно, с предшествующих открытий ДНК, принципа комплементарности, составляющих её аминокослот и использования фермента полимеразы для увеличения количества фрагментов лизированной ДНК.

Что такое – ПЦР – диагностика? ПЦР – это полимеразная цепная реакция. Из названия становится ясно, что основной компонент реакции – фермент полимераза, причем необходима термоустойчивая разновидность. Цепная реакция – это потому, что протекает она по типу ядерной реакции. В короткое время обеспечивается увеличение количества определяемой нуклеиновой кислоты в 2-4-8-16 и т. д. раз в геометрической прогрессии…

Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR)изобрёл в 1983 году американский учёный Кэри Мюллис, работавший в области молекулярной биологии над созданием прибора под названием амплификатор.

Интересны обстоятельства, при которых у него появилась эта идея. Вот как это было… Открытию предшествовали размышления исследователя о проблеме разрушения обычной полимеразы в процессе воздействия высоких температур (до 95 град. С). В тёплую лунную майскую ночь биолог возвращался со своей дамой с дружеской вечеринки, девушка спала на заднем сидении кабриолета… Кэрри Мюллис вёл машину по пустынной дороге, освещенной лунным светом. И вот при таких романтических обстоятельствах у него появилась идея использовать полимеразу термоустойчивых бактерий, обитающих в термальных источниках!

В 1993 г. за воплощение в лабораторную практику молекулярной биологии этого изобретения он получил Нобелевскую премию.

В настоящее время ПЦР-диагностика является одним из самых точных и чувствительных методов диагностики инфекционных заболеваний, наследственных патологий, определения генетически модифицированных продуктов, идентичности биологического материала, в том числе в судебной практике.

ПЦР – диагностика стала необходимым элементом при постановке диагноза вирусных гепатитов В и С, назначении лечения интерферонами и его корректировке по дозам и срокам специфического лечения.

Различают методы ПЦР: с учётом по конечной точке методом электрофореза, флюоресцентной детекции на приборах «АЛА 1\4» (Латвия), «Джин» ( Россия), полуколичественный метод, и самый современный метод – в режиме реального времени с использованием надёжного специального оборудования.

Эпидемии гриппа А Н1N1 (Калифорния 09) 2009 г. и прошедшего эпидсезона 2015-2016 годов показали, что Роспотребнадзор по Республике Дагестан успешно справился с задачей диагностики гриппа и других острых респираторных вирусных инфекций у больных с тяжёлыми формами респираторной патологии.

ПЦР – диагностика с помощью мультиплексных тест-систем (на несколько инфекций) с успехом используется не только в диагностике ОРВИ, пневмоний, менингитов, а также для расшифровки вспышек пищевых токсикоинфекций, как на бактерии, так и на вирусы.

Источник