чем заменить чашку петри

кофемолки отлично справляються с работой гомогенизатора

Для сиквенсных гребенок (около 0,2 мм) хороши пластиковые игральные карты, какой там материал не знаю, но не тефлон (кислород не пропускают и полимеризуется гель впритык к зубу). У моего приятеля из них получился даже вполне рабочий акулий зуб. Карты были российскогопроизводства. Краска с карт смывается практически любой органикой.

Дополнение насчет Programmable Pressure Cookers:

Сейчас на еВау они стоят дешевле, есть много маленьких (4-5-6 литров), есть использованные, но в хорошем состоянии (like new), которые можно купить за 20-40 долларов + shipping.

Мне нужны главным образом гребенки с очень большим количеством зубьев, чтобы можно было сразу посмотреть большое количество клонов (по крайней мере 96 на одну гребенку, три гребенки в геле 20 см шириной). Фрезеровать из фторопласта я не имею возможности, и сомневаюсь, что нужные мне маленькие и частые зубья можно получить таким образом. Меня вполне устроят гребенки с примерно такими параметрами:

Лишь бы гель не рвался, когда вытаскиваешь гребенку (что зависит от материала гребенки).

Я смотрел в магазинах на многие обычные гребенки для волос, пока не нашел таких, которые можно было бы использовать для этой цели. Недостатки: зубья на концах утончаются (коническая форма); форма зуба ромбообразная, причем длинная ось направлена вдоль направления движения ДНК на форезе; чаще всего в одной гребенке два варианта с разными расстояниями между зубьями. Ищу металлические гребенки с круглыми в сечении зубьями. Такие делаются для домашних животных, но те, что я видел, имели слишком большие расстояния между зубьями. Подозреваю, что кроме именно гребенок (для волос которые), подобные гребенкообразные конструкции выпускаются еще для чего-то, для других целей. В приборах каких-нибудь используются.

2 RYM: А для гребенки не подойдет обычная пластмассовая линейка, можно поискать по толщине и качеству. Удобно выпиливать зазоры между зубьями.

Подойти, наверно, подойдет. Только как я буду зазоры выпиливать? Сам, без мастерских, которые всегда были и есть при советских/российских институтах? Чем выпиливать, как добиться полной идентичности получающихся зубьев?

Идентичность для меня важна, чтобы можно было сравнивать относительную яркость соседних полосок (для количественной оценки).

Выпиливать можно лобзиком. Не знаю, я например использовал для анализа клонов, и вполне годилось. Но наверное вы правы, что это выход для рутинных операции, не требующие количественной оценки.

Если нужны зубья с круглым сечением, то сверлишь отверстия и вклеиваишь туда кусочки пластикового прутка.

Я предлагаю не использовать насосы для смены буферов в электрофоретических камерах. У меня свежий буфер капает сверху из банки с выведенной трубкой, а выводится через S-образный сифон, как в экстракторе Сокслета. Под электрофорезером стоит поддон и туда все сливается.

Мы иногда занимаемся крупными объёмами, так вместо большой мешалки с баком решили использовать стандартный китайский тестомес. Бак из нержавейки, редуктор тихо работает, всё компактно и удобно. Можно найти тестомес с вращающимся баком, вааще атас.

а какие мысли в чем можно откручивать (скидывать 1000g) пцрные платы на 96 без спец центрифуги?

Fox, чем у вас пользуются для запечатывания плат?

испаряется редко-редко, когда реально плохо закрываешь, правда по 5 мкл никто не ставит.

ЗЫ Собственно в Питере на ротор (килоеврик) жаба душит.

Но если сильно нуждаетесь и есть кому дюралий пилить, то могу размеры снять..

Я обычно всякую муть, белок или клетки сбрасываю в круглодонных платах, супер переношу в новые плоские и провожу реакции необходимые или сразу делаю спектрофотометрию на платовом СФ. Просто сказка! Экономия реактивов да и биологические образцы можно поменьше брать.
Мы в лабе уже очень многие биохимические методы перевели на платы.

Да кстати, изготовить пару таких «подвесок» на любом заводе можно за цену довольно смешную.. Если не лень жестяньщика-фрезеровщика найти.

Картинки:

plate96Holder.jpg — (37.56к)

Поблагодарили (1): Baudelaire

Выложены давно обещанные «методики» изготовления форезных камер:

Всем приятного использования!

Чуть переделана программа «Расчёт параметров PCR». Добавлена возможность задавать количество матрицы весом геномной дНК ряда организмов. Заодно программой можно пользоваться для расчета количества копий гена в данном количестве геномной ДНК.

Подойти, наверно, подойдет. Только как я буду зазоры выпиливать? Сам, без мастерских, которые всегда были и есть при советских/российских институтах? Чем выпиливать, как добиться полной идентичности получающихся зубьев?

Идентичность для меня важна, чтобы можно было сравнивать относительную яркость соседних полосок (для количественной оценки).

самодельный покрашенный маркер для вестерна. я правда сам красил тока Remazol Brilliant Blue R.

Источник

Строим дом для бактерий

Строим дом для бактерий

Знаете ли вы, сколько бактерий обитает на ваших ладонях? А на крышке телефона? А на каком-нибудь предмете, которым вы пользуетесь каждый день и, как вам кажется, содержите в чистоте? Нет? Хотите посмотреть? Предлагаем доступный способ увидеть мир, обитающий на кончиках пальцев.

Что понадобится

1. Бульон:

2. Стерильные чашки Петри (5–10 шт.):

Это такая стеклянная или пластиковая лабораторная посуда, состоящая из двух плоских чашек, которые входят друг в друга. Такое строение служит для защиты от внешних загрязнений или газов, выделяемых самими колониями бактерий. Чашки Петри продаются в большинстве аптек, стоят дёшево.

3. Холодильник.

4. Термометр.

5. Ватные палочки (20 шт.).

6. Антибактериальное мыло (для проверки).

7. Маска, перчатки.

8. Раствор хлора, например жидкость «Белизна» (0,5 л).

Последовательность действий

Строим дом

1. Подготовьте среду для роста и размножения будущих бактерий: сварите мясной бульон. Лучше поварить мясо подольше, чтобы получилось наваристее.

2. Добавьте в сваренный бульон агар из расчёта 1/2 чайной ложки (1,2 г) на каждые 1/4 стакана (60 мл жидкости). Это количество подходит для одной чашки Петри.

3. Разогрейте вашу свесь в микроволновке, доведите до кипения, и дождитесь, пока весь порошок агара не растворится. После этого остудите.

4. Возьмите чашки Петри. Обратите внимание: они должны быть стерильными внутри! Если не уверены, окуните в кипяток, только аккуратнее, чтоб не ошпариться. Чтобы не занести бактерии из воздуха, лучше проделывать все операции возле горящей газовой горелки.

5. Залейте питательную смесь в нижнюю половинку тонким слоем, лишь слегка покрывающим дно, и как можно быстрее закройте ёмкость верхней чашкой. Дайте остыть.

6. Поставьте закрытые чашки Петри в холодильник. Лучше, чтобы нижняя половинка оказалась сверху. Это нужно, чтобы предотвратить разрушение среды каплями конденсата. Дождитесь, пока среда станет похожей на твёрдое желе. Готовые чашки Петри могут храниться в холодильнике около двух месяцев.

Новоселье

1. Достаньте чашки Петри из холодильника и разогрейте их до комнатной температуры. Теперь можно приступать к заселению! Тут есть множество вариантов — всё зависит от вашей фантазии. Мы решили посмотреть, какие бактерии живут на кончиках пальцев.

2. Прикоснитесь к желе поочерёдно пятью пальцами в разных местах. Делать это надо аккуратно, не повреждая поверхность. Накройте ёмкость со следами пальцев верхней чашкой (это надо делать очень быстро) и запечатайте, например, клейкой лентой. На нижней поверхности чашки маркером обведите отпечатки пальцев и подпишите.

3. Поставьте заселённые «дома» в тёплое и тёмное место. Со вторым пунктом всё вроде бы понятно, но что касается тепла — бактерии достаточно привередливы и наиболее активно растут при +37 градусах. Для того чтобы определить оптимальный режим, возьмём термометр и измерим температуру тёплых поверхностей в доме — например, за холодильником. Время роста в этом случае составит 1–2 дня. Можно выращивать бактерии и в более прохладных условиях, но тогда процесс будет идти гораздо медленнее.

4. Зафиксируйте результаты: через сутки маркером начните рисовать круги на внешней стороне дна чашки вокруг разросшихся бактерий, плесени, грибков или других «жильцов». Так вы будете ежедневно получать информацию, каким образом и с какой скоростью заселяется «жилплощадь» (возможно, появится рисунок, напоминающий срез дерева).

5. Попробуйте идентифицировать микроорганизмы, колонии которых вырослив чашках. Для этого у микробиологов есть множество способов типа выделения чистой культуры, окраски по Граму, биохимических проб. Мы сможем использовать лишь некоторые — определить цвет и форму колонии.

6. Проверьте действие антибактериального мыла. Как только в чашке Петри разовьётся жизнь, нанесите ватной палочкой каплю мыла между двух колониальных островков. Закройте чашку и оставьте её ещё на сутки в тёплом и тёмном месте. Области заселения будут разрастаться вокруг капли на некотором отдалении от неё, и чем активнее вещество, тем шире окажется «зона отчуждения».

Знакомство

Можно просто оставить отпечаток своих пальцев (тогда вам понадобится только одна чашка Петри). А можно провести эксперимент и сравнить состав «жильцов» в разных ситуациях (для этого придётся задействовать несколько чашек), например:

Для сравнения оставьте в одной из чашек отпечатки максимально чистых рук (помыть антибактериальным мылом, протереть дезинфицирующим раствором).

На ваших пальцах обитают самые разные виды микроорганизмов, и определить, что в каком месте выросло, очень сложно. Можно лишь делать предположения, например:

Разумеется, точно определить микробов можно только в лаборатории.

Выселение

Рано или поздно колония полностью удовлетворит ваше любопытство и по закону роста микроорганизмов начнёт погибать. А это значит, что пришла пора от неё избавиться — жёстко и беспощадно, чтобы освободить дом для новых жильцов. Ну, или решить, что быть микробиологом не ваше призвание, и избавиться от чашек Петри. На самом деле колонии, выросшие по мановению вашей руки, вряд ли опасны, однако это не освобождает вас от обязанности похоронить их по всем правилам микробиологии со всеми ритуалами и почестями.

1. Обеспечьте себя защитой: наденьте фартук, маску и резиновые перчатки.

2. Залейте чашки Петри небольшим количеством хлорного раствора и оставьте на несколько минут.

3. Вылейте содержимое, ополосните чашки, положите их в пакеты, а после — в мусорное ведро.

Предупреждение: если вы захотите самостоятельно продолжить эксперименты по выращиванию микробов, не используйте какие-либо биологические жидкости (например, слюну), иначе можно вырастить колонии, опасные для здоровья. Соблюдайте меры предосторожности и будьте аккуратны!

Опубликовано в журнале «Кот Шрёдингера» №9 (11) за сентябрь 2015 г.

Источник

Чем заменить чашку петри

Начну с того, какие кухонные дешевые устройства можно использовать вместо лабораторных приборов:

1. Замена автоклава

2. Замена Magnetic Stirrers и Hot Plates.

3. Замена водяных бань.

4. Замена чашек Петри для бактерий.

Бактериальные чашки Петри стоят довольно недорого, но тем не менее. Во-первых, иногда бывают нужны маленькие чашки (3-6 см диаметром), а они выпускаются только для tissue culture и стоят значительно дороже. Во-вторых, в российских условиях имеет смысл экономить и эти деньги, лучше их потратить на что-то другое.

Можно использовать металлические подносы для приготовления кексов или что-то подобного (в России я не интересовался названиями кухонных приспособлений), по английски muffin pan. Они бывают на 6, 12, и 24 muffins. Простериливать их можно автоклавированием или У/Ф облучением.

5. Замена ice buckets.

6. Замена enzyme coolers (типа Stratacoolers).

Я использую маленькие платиковые кулеры (см. п. 5): держу ферменты, часто нужные для работы в таких кулерах и достаю их из морозильника, когда нужно что-то взять из них. В кулере стоят алюминиевые блоки от dry-bath incubators, на дне кулера чистый песок (можно что угодно, например, мелкие металлические предметы, хоть стружку металлическую, хоть мелкие гвозди, хоть гайки ненужные). Если нет ненужных блоков (от поломанных dry-baths и т.п.), можно взять обычные штативы для эппендорфов или ПЦР пробирок и положить на песок или мелкую металлическую стружку в кулере, и держать в морозильнике.

7. Замена dry-bath incubators.

=========================
Потом я буду добавлять. Хотелось бы услышать рекомендации по поводу замены типичных реагентов, если у кого-то есть успешный опыт: например, что можно использовать вместо агара (желатин?), бактотриптона, дрожжевого экстракта, и пр.

А как, из чего лучше сделать самодельную гребенку для фореза? Особенно частую гребенку. Что можно использовать как «полуфабрикат»?

Silica-spin колонки по качеству эквивалентные Qiagen: http://molbiol.ru/protocol/12_06.html

Так как с сайтом вроде устаканивается, надеюсь, что скоро будут ещё (можно сказать, анонс):
чертежи самодельных форезных камер,
приготовление hot-start Taq (по качеству эквивалентно AmpliTaq Gold)
приготовление термостабильной лигазы

Дополнение насчет Programmable Pressure Cookers:

Сейчас на еВау они стоят дешевле, есть много маленьких (4-5-6 литров), есть использованные, но в хорошем состоянии (like new), которые можно купить за 20-40 долларов + shipping.

Мне нужны главным образом гребенки с очень большим количеством зубьев, чтобы можно было сразу посмотреть большое количество клонов (по крайней мере 96 на одну гребенку, три гребенки в геле 20 см шириной). Фрезеровать из фторопласта я не имею возможности, и сомневаюсь, что нужные мне маленькие и частые зубья можно получить таким образом. Меня вполне устроят гребенки с примерно такими параметрами:

Лишь бы гель не рвался, когда вытаскиваешь гребенку (что зависит от материала гребенки).

Я смотрел в магазинах на многие обычные гребенки для волос, пока не нашел таких, которые можно было бы использовать для этой цели. Недостатки: зубья на концах утончаются (коническая форма); форма зуба ромбообразная, причем длинная ось направлена вдоль направления движения ДНК на форезе; чаще всего в одной гребенке два варианта с разными расстояниями между зубьями. Ищу металлические гребенки с круглыми в сечении зубьями. Такие делаются для домашних животных, но те, что я видел, имели слишком большие расстояния между зубьями. Подозреваю, что кроме именно гребенок (для волос которые), подобные гребенкообразные конструкции выпускаются еще для чего-то, для других целей. В приборах каких-нибудь используются.

Подойти, наверно, подойдет. Только как я буду зазоры выпиливать? Сам, без мастерских, которые всегда были и есть при советских/российских институтах? Чем выпиливать, как добиться полной идентичности получающихся зубьев?

Идентичность для меня важна, чтобы можно было сравнивать относительную яркость соседних полосок (для количественной оценки).

Fox, чем у вас пользуются для запечатывания плат?

испаряется редко-редко, когда реально плохо закрываешь, правда по 5 мкл никто не ставит.

ЗЫ Собственно в Питере на ротор (килоеврик) жаба душит.

Но если сильно нуждаетесь и есть кому дюралий пилить, то могу размеры снять..

Я обычно всякую муть, белок или клетки сбрасываю в круглодонных платах, супер переношу в новые плоские и провожу реакции необходимые или сразу делаю спектрофотометрию на платовом СФ. Просто сказка! Экономия реактивов да и биологические образцы можно поменьше брать.
Мы в лабе уже очень многие биохимические методы перевели на платы.

Да кстати, изготовить пару таких «подвесок» на любом заводе можно за цену довольно смешную.. Если не лень жестяньщика-фрезеровщика найти.

Картинки:

plate96Holder.jpg — (37.56)

Выложены давно обещанные «методики» изготовления форезных камер:

Всем приятного использования!

Чуть переделана программа «Расчёт параметров PCR». Добавлена возможность задавать количество матрицы весом геномной дНК ряда организмов. Заодно программой можно пользоваться для расчета количества копий гена в данном количестве геномной ДНК.

Подойти, наверно, подойдет. Только как я буду зазоры выпиливать? Сам, без мастерских, которые всегда были и есть при советских/российских институтах? Чем выпиливать, как добиться полной идентичности получающихся зубьев?

Идентичность для меня важна, чтобы можно было сравнивать относительную яркость соседних полосок (для количественной оценки).

Источник

• ← что такое дениш для обработки дерева
• чем закрыть крышку улья →